La Chiesa di Santa Maria delle Grazie è una delle più importanti chiese della città di San Giovanni in Fiore, essendo il secondo edificio religioso per dimensioni, nonché il secondo edificio di culto realizzato nella cittadina florense.La sua importanza è riconosciuta anche dall'esser la Chiesa Madre della città, affacciandosi, inoltre sulla antica piazza cittadina intitolata all'abate Gioacchino da Fiore.

La storia della Chiesa è correlata ed intrecciata alla storia della città. La sua fondazione si fa risalire al periodo della nascita della città civica di San Giovanni in Fiore, quando all'allora abate Salvatore Rota, venne concesso la costituzione di una "fondazione universitaria" (città) nei territori della Sila abbadiale. La nascita della chiesa è fatta risalire a qualche anno prima dell'istituzione civica, quando l'abate iniziò l'opera di realizzazione della chiesa poiché ritenuto necessario, anche in conseguenza del degrado in cui stava versando l'Abbazia in quel periodo. Salvatore Rota, inoltre, fece coincidere la costruzione della Chiesa con il primo intervento urbanistico della nuova città. È infatti di quel periodo la realizzazione del primo asse “stradale” sterrato (sielica), che partendo dall'Abbazia, sproseguiva salendo verso il costone ove ora si trova l'attuale rione "Curtigliu", aprendosi poi in uno spiazzo centrale, divenuto poi l'attuale Piazza Abate Gioacchino, ed trasformando così l'area dove realizzare il nuovo edificio religioso. La storia della Chiesa di Santa Maria delle Grazie, è suddivisibile in tre periodi architettonici diversi:

• il primo risale alla data della sua costruzione (intorno al 1530), quando la chiesa venne edificata in ridotte dimensione; la primordiale chiesa era ad un'unica navata. Coincide in questo periodo la perimetrazione dell'area che sarebbe diventata in seguito la piazza antistante, utilizzata, però, in quel periodo a mo' di orto;
• il secondo periodo, risalente a metà '600 circa, coincide con il primo ampliamento della chiesa, che oltre alla navata centrale, presentava una navatella laterale posta sul lato sud; la chiesa era però, ancora di ridotte dimensioni, tant'è che si ritenne necessario il suo abbattimento e il completo rifacimento, con un edificio molto più grande ed ospitale, per poter accontentare la richiesta della popolazione, in un periodo di forte aumento demografico della città;
• il terzo periodo è quello Barocco, e dunque, quello della completa demolizione e ricostruzione della Chiesa nelle forma attuali a tre navate, realizzazione che fu intrapresa dall'abate commendatario Giacomo Filomarino, e terminata nel 1770.